Keio Flying Squadron sur Mega CD est un jeu de tir au scrolling horizontal où le joueur prend le contrôle de Rami Nana-Hikari, une jeune fille aux pouvoirs magiques. Accompagnée de son fidèle dragon, elle part à l'aventure pour retrouver un trésor familial volé par le maléfique Dr Pon. Le jeu se distingue par ses graphismes colorés et ses nombreux défis, tout en offrant une variété d'attaques et de bonus, y compris des options de soutien sous la forme de mini dragons qui peuvent aider Rami dans ses combats. Les combats peuvent se conclure par une attaque spéciale dévastatrice, ajoutant du suspense à l'expérience de jeu.