Dans Assassination Classroom : The Great Siege, les joueurs plongent au cœur d'une aventure explosive où ils doivent unir leurs forces pour affronter un professeur extraterrestre redoutable. En incarnant des élèves de la classe 3-E, les participants devront concevoir des stratégies astucieuses, résoudre des énigmes et participer à des batailles intenses pour protéger leur école et sauver le monde d'une menace imminente.