Jewel Link Mysteries: Mountains of Madness plonge les joueurs dans une aventure intrigante au cœur de l'Antarctique, où ils doivent résoudre le mystère de disparitions inquiétantes. En combinant la recherche d'objets cachés et des énigmes variées, le jeu propose également des mini-jeux où les joueurs doivent aligner des gemmes de la même couleur pour progresser dans l'histoire.